重庆工商大学始终坚持以学科建设为引领，以高素质创新型人才培养为目标，经过10多年来的不懈努力，学校学位与研究生教育取得了长足的发展。

学校现有应用经济学博士后科研流动站1个，博士后科研工作站2个，服务国家特殊需求博士人才培养项目1项（应用经济学一级学科），一级学科硕士学位授权点8个，二级学科51个，专业学位授权点5个，拥有应用经济学、工商管理、管理科学与工程、环境科学与工程等8个省部级重点学科，2个重庆市特色学科专业群，每年面向 全国招收 博士、硕士研究生600人左右。

学校拥有“新世纪百千万人才工程”国家级人选、“长江学者奖励计划”人选、国家级有突出贡献中青年专家等一支学术水平高、培养经验丰富、敬业精神强的导师队伍；建有“长江上游经济研究中心”教育部人文社会科学重点研究基地、“废油资源化技术与装备”教育部工程研究中心、“电子商务及供应链系统”重庆市重点实验室等15个国家级、省部级教学科研平台。

学校不断创新培养模式，优化培养机制，设置了完善的研究生实践创新能力培养体系，设立有优越的学业奖励和资助制度，培养质量稳步提升。近年来，研究生高水平学术论文、授权发明专利等科研成果逐年增加，多次荣膺“挑战杯”等重要学科竞赛全国金、银、铜奖，省部级优秀硕士学位论文近20篇，研究生暑期挂职锻炼等社会实践活动赢得了良好的社会声誉，初次就业率、优质就业率历年来均名列重庆市前茅，一大批毕业研究生已成为所在行业领域的中坚骨干力量。